巴拿馬運河附加費（Panama Canal Transit Fee，縮寫PTF）是由巴拿馬運河管理局（PCA）收取，用于彌補巴拿馬運河每年的保險成本、維護費用等一系列開支，并從中賺取一定的利潤。隨著旺季的到來，大船過運河數(shù)量不斷增加，該費用可能隨之提高。PTF費用一般在美國航線以及中南美航線收取。

1914年8月15日巴拿馬運河正式通航，極大地縮短了美國東西海岸間的航程，比繞合恩角縮短了1萬4千8百公里。

在美國管理時期，運河通行費的費率是按維護和營運的成本計算的，因而運河的經(jīng)費是自籌的。每次通行收取的費用根據(jù)船舶裝貨或載客的容量計算。1914年設(shè)定的費率實際上一直沒變，持續(xù)60年之久。1973年運河的經(jīng)營第一次虧損，1974年第一次調(diào)高幾項費率。

傳統(tǒng)上，貨物都裝在甲板之下，通行費是按倉內(nèi)所載貨物計算。然而，由于船 舶設(shè)計的改變，以及廣泛以貨柜運送貨物，所以一大部分裝載貨物是在甲板上。通過運河的貨柜貨物量僅次于谷物和石油產(chǎn)品的裝運。這些變化導(dǎo)致計量規(guī)則的改變 和制定甲板上貨柜箱容量通行費的估定辦法。在巴拿馬運河委員會的領(lǐng)導(dǎo)下，巴拿馬運河管理局批準了在計量規(guī)章上的類似改變，并在運河移交之后仍然保持美國管 理時期的通行費費率。

從收取的通行費中，巴拿馬運河管理局必須繳納給巴拿馬國庫年度稅費。在繳納年度稅費并付出運河的營運與維護開支后，所有的盈余也都全部上繳國庫。